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MeRIP-Seq/m6A-Seq整体服务全面升级

从m6A-IP、建库测序分析及MeRIP-qPCR一站式服务
高成功率的ng级建库
一网打尽mRNA、长链非编码RNA

锐博生物提供的MeRIP-Seq(Methylated RNA Immunoprecipitation Sequencing)利用单克隆抗体抓取存在m6A修饰的RNA片段,结合高通量测序,实现转录组学范围内的m6A peak检测与motif分析,覆盖从m6A-IP、建库测序分析及MeRIP-qPCR一站式服务。

锐博优势技术特色

1、平台完整: MeRIP实验—建库测序分析—MeRIP qPCR验证,真正一站式服务
2、高成功率:成功开展超过1000例样本,支持低至ng级别RNA建库
3、灵活选择:建库方式和文库片段大小可选
4、重复性好:丰富的项目经验确保实验重复性,已进行多样本间的比较分析

项目样品准备

1、组织:建议>3g,部分RNA量少的组织可能需更多的组织。
2、细胞:建议> 2×107,部分RNA量少的细胞可能需更多的细胞。
3、total RNA:建议>100 μg。

推荐测序模式及数据量

illumina SE50,20M clean reads
illumina PE150,6G clean data

研究思路

illumina SE50,20M clean reads
illumina PE150,6G clean data

结合峰分析

motif检测

详细分析报告模板请与销售代表联系!

如何委托以上MeRIP-seq(m6A)整体服务?

请登陆锐博生物官网kamatm.com,花3分钟注册一个账户,即可在线委托MeRIP-seq整体服务啦~~~

1、账户注册审核通过后,只需点击以下链接:http://kamatm.com/our-services/,进入锐博官网委托技术服务页面。
2、选择需要委托的服务项目,如MeRIP-seq,则点击进入高通量测序模块。
3、填写需求信息并提交,选择需要委托的测序服务类型MeRIP-seq,并填写样本等信息,直接提交成功。

关于m6A研究背景

请登陆锐博生物官网kamatm.com,花3分钟注册一个账户,即可在线委托MeRIP-seq整体服务啦~~~

m6A修饰普遍存在于mRNA 和多种类型的非编码RNA,通过影响RNA加工成熟、稳定性、mRNA运输与翻译、RNA编辑等方面,参与肿瘤发生和转移、胚胎发育、DNA损伤修复和病毒感染等生物学功能和作用机制的研究。相对于研究较早的DNA和组蛋白表观修饰,近年来发现,RNA上也存在类似的调控机制。RNA修饰超过150种,N6-methyladenosine (m6A)作为最常见的转录后修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。这种甲基化修饰非常普遍,其功能由“编码器Writer”、“消码器Eraser”和“读码器Reader”介导。

RNA N6‐methyladenosine methyltransferase‐like 3 promotes liver cancer progression through YTHDF2‐dependent posttranscriptional silencing of SOCS2[J]. Hepatology, 2018, 67(6):2254.

Writer即甲基转移酶,在体内和体外催化RNA发生m6A甲基化修饰,包括METTL3、METTL14和WTAP,VIRMA和RBM15可能也算上。Erasers即去甲基化酶,将RNA甲基化修饰信号擦除,包括ALKBH5和FTO。Readers即可识别RNA甲基化修饰的读码器,会参与后续的RNA翻译、稳定性、剪切和转运等过程,包括含YTH结构域的YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、YTHDC1和YTHDC2。

研究切入点

1、Cui Q, Shi H, Ye P, et al.在细胞内敲低甲基转移酶METTL3和METTL14蛋白的表达,可以诱导 GSCs内原癌基因的表达,促进GSCs的生长、自我更新和分化。
2、Ma J Z, Yang F, Zhou C C, et al. METTL14通过调控pri-miRNA的m6A修饰,影响miR-126的生成加工,从而抑制肝癌的转移。
3、Li Z, Weng H, Su R,et al. FTO作为第一个被发现的去甲基酶,可影响剪切因子SRSF2的RNA结合能力,进而调控pre-mRNA的剪切加工过程。
4、Zhao B S, Wang X, Beadell A V, et al. YTHDF2可以识别修饰后的mRNA,并介导m6A依赖的RNA降解过程。
5、Yang X, Laurent B, Hsu C H, et al.由甲基转移酶METTL3和去甲基化酶FTO共同调控的RNA m6A甲基化修饰,会指导Pol κ在DNA损伤位点聚集,促进损伤的修复,
6、Yang Y, Fan X, Mao M, et al. m6A识别蛋白YTHDF3能够结合到环状RNA的修饰位点并募集eIF4G2和其他翻译起始因子来驱动环状RNA的翻译。
仍待探索多种可能… …

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